继续延续上一季的剧情，原来穆德受了骗，及时发觉错误后和史考莉串通好来骗政府高层，以潜入一个“作为一个普通FBI特别探员不该进入的地方”搜集需要的资料。本季发展越来越精彩，一些没有被完全改造的混血外星人联合起来抵抗殖民阴谋。史考莉被绑架时子宫被移除，但今年却出现了她的孩子——艾蜜莉。今年制作小组甚至找了两位知名科幻小说家操笔，客串写出两集剧本。另外今年也有一集喜剧。整出X档案为了配合电影的上映，加入了一些角色及内容，“辛迪加”组织的阴谋越来越明显，穆德再一次接近事实的真相。穆德前女友的出现也对穆德与史考莉间的关系做出重大考验。该季结束于吸烟人烧毁了所有X档案卷宗。
艾伦·艾克哈特,丽亚娜·莱伯拉托,欧嘉·柯瑞兰寇,加里克·哈根,艾力克·高敦,雅辛·法德尔,尼尔·纳皮尔,大卫·巴克·琼斯,亚历山大·费林,Ronnie Commissaris,Katelijne Verbeke,John Dobrynine,Ben Van Ostade,Jade Hassouné,Richard Robitaille,凯特·林德尔,Steve Barry,Damien Marchal,Sebastien Soudais
俄罗斯电影
白彪,李修贤,孙建,詹森
大鹏,柳岩,代乐乐,张子贤,田雨,孟鹤堂,陶慧,许娣,王戈,杜源,阿如那,张绍荣,张帆,夏甄,杨砚铎,臧鸿飞,李萍,乔晟一,孟非,屈菁菁,腾格尔,叶晞月,杜维瀚
俞知媛,李政成,南宫原,鲜于,金大云
Karoline,Schuch,Max,Mauff,Doron,Amit
